審計署關注，部份學券計劃下的幼稚園收取過多雜費，個別幼稚園雜費收入，相當於學費收入的兩成四至四成四，有幼稚園把雜費收入撥入「其他營運收入」項目，以避過利潤上限的規管，令教育局無從查核有關的雜費水平是否合理。教育局亦發現，在10/11 學年約有一百二十所學券制幼稚園，就售賣自選教育用品和提供收費服務所賺取的款項，超過利潤上限。教育界立法會議員葉建源認為，現時教育局無規管幼稚園的雜費開支，是一個很大的漏洞，需要堵塞。但他認為，幼稚園面臨的營運開支亦很大，政府應加強資助，包括增加學券面額。