針對台灣漁船被菲律賓公務船開槍掃射，一名漁民死亡，總統馬英九指，任何一個國家在自己專屬經濟區有權可以執法，但按照國際海洋法規定，最多是登船檢查，不能使用武力。台灣會據理力爭，追究到底，並已經向菲律賓表達強烈憤怒，讉責行凶行為，希望盡快跟對方就此事展開對話。馬英九指，目前在護漁方面，主要讓海巡署掌握漁船行蹤，在可能發生糾紛的地方經常巡邏。