在台灣，總統馬英九表示，菲律賓總統阿基諾三世，透過馬尼拉經濟文化辦事處主席，就漁民被槍射表示歉意，但就指是「非蓄意」的生命損失，是刻意淡化事件的嚴重性。馬英九強調不能接受這個說法，指菲律賓公務人員，用自動武器掃射無武裝，亦無進行挑釁的漁船，已經是冷血的謀殺，會跟菲律賓繼續交涉。馬英九指國際間都不接受用武力解決問題。他要求盡快解決，希望菲律賓正式道歉、賠償損失、徹底調查、懲罰兇手，以及同台灣商談漁業協議。