政府早前就新界東北發區計劃提出修訂方案，有古洞村居民不滿政府未有清楚交代賠償方案，並要求政府撥地重建古洞村。居民指，很多村民的住戶結構複雜，例如由幾兄弟姊妹等多個家庭組成一戶，但政府未有清楚交代，這些家庭是否只獲發一筆最高六十萬元現金賠償。而部份擁有私人土地的村民，是否亦一刀切，只獲得同等數額的特惠賠償，以及商戶、村內醬油廠及豆品廠等，會否獲另覓土地經營，政府亦未有交代。