署理食物及衛生局長陳肇始說，非常關注威爾斯醫院心臟科主管余卓文被禁止做手術的事件，已指令在醫管局總部層面，成立獨立委員會調查事件，希望有關涉及的醫生會協助調查，並已指示醫管局確保調查公平謹慎，盡快完成，將報告呈交給食衛局，維持公眾對公營醫療服務信心。陳肇始形容今次是個別事件，局方對事件十分關注，希望調查可以釋除公眾疑慮。醫管局行政總裁梁栢賢說，會很嚴肅處理事件，派出醫管局總部總監督導，肯定調查公平公正，並邀請外國專家檢視，而新界東聯網總監馮康被投訴事件，亦會成立小組跟進。