全國港澳研究會副會長劉兆佳，在一個電視節目說，研究會成立與政改沒有直接關係，研究會既是學術研究機構，亦對政策有影響力，因此是同時面向公眾及政府。劉兆佳指，零三年七一大遊行開始，引發中央對香港問題的憂慮，過去幾年內地出現不少研究港澳問題的組織，反映中央有意鼓勵研究，想更好運用中央職能。劉兆佳指，基本法對包括中央與本港行政立法機關的關係，以及一些述職任命方式等，只是輕輕帶過，因此有必要研究將這些問題制度化，否則隨著兩地日後接觸越來越多，容易出現更大摩擦。這些研究將由宏觀戰略角度，探討如何推行一國兩制。被問到是否包括基本法廿三條議題，劉兆佳指，研究由個別學者進行，現階段不能確定有甚麼議題。