黃大仙祠在新春期間，將會有特別安排，方便善信上頭炷香和參拜。在年三十晚，黃大仙祠的開放時間將由上午七時至下午五時半，及晚上九時至翌日年初一下午六時半。在年三十晚，黃大仙祠不設跪拜、求籤區及貢品供奉區，祠方亦呼籲善信避免攜帶大型貢品如燒豬等入祠。在年初一至初十五期間，黃大仙祠亦會實施單向人流管制安排，在廟外設置兩個排隊區，分別通往大仙祠及太歲元辰殿，廟內將設三個上香區，每名善信只可攜帶九支線香，禁止攜帶元寶、粗香和蠟燭。