中國證監會發言人表示，現時滬港通設定總額度是五千五百億元，整體目標是人民幣流入及流出量基本平衡，推行一段時間後，會視乎情況調節，而非交易事項的資金流量不會佔用額度。A+H股上市公司可在兩地交易所收市後至第二日開市前的重疊時段，同步披露訊息，保證兩地投資者同等享有訊息知情權；而非A+H公司，將根據上市地交易所要求披露訊息。中證監又說，雙方已商定，如果一方開市一方休市，休市的一方不會提供開市一方交易的服務，並提前發公告，指如果在差異時間交易，兩地銀行工作日不一致，將影響兩地資金交收。
至於收費和稅收安排，中證監指，基本原則是按照滬港兩地交易所及結算所的稅項標準收費，在推行初期，香港投資者投資上海證交所的產品，相關稅費暫時按照合格境外機構投資者，即是QFII來管理。