運輸及房屋局公布南丫海難的內部調查報告，指十七名海事處人員，在過去執行有關失事船隻南丫四號的職責時，行為不當，調查小組建議，對十三名在職人員，包括兩名首長級人員，採取紀律行動，考慮對當中七人展開正式紀律程序，餘下六人就給予警告。至於另外四名已退休的人員，雖然已經無法對他們採取紀律行動，但小組指，如果他們在職，亦應對他們展開紀律程序或採取簡易紀律行動。小組又指，調查過程中，發現懷疑涉及刑事罪行的問題，已經轉介警方處理。
報告指，由於內容有可能妨礙正在進行的刑事調查，以及可能進行的刑事和紀律程序，因此未有公開有關人員的姓名，亦未有詳述涉及刑事問題的事宜。