立法會發展事務委員會以一票之微，通過支持蓮塘/香園圍口岸申請追加八十二億工程撥款。土木工程拓展署署長韓志強說，曾經考慮不同方案，如果停止目前三份合約工程，將會造成重大損失，而拖延工程亦對減少超支並無幫助，反而目前已能把握造價，相信不會再超支。發展局副秘書長陳志明指，事件與高鐵工程延誤不同，局方一直有了解工程情況，已嘗試用較多預製組件，減省開支。
多名議員批評超支過多。其中建築、測量規劃界謝偉銓批評，政府的預算與現實差距甚大，相關官員是失職，擔心超支情況會擴展至全部項目。民主黨郭家麒批評，政府默許一超支便以公帑支付，無做好把關，情況不能接受。保險界陳健波認為，為免工程爛尾，在無辦法下仍要支持。