在立法會一個小組委員會上，身兼西九管理局主席的政務司長林鄭月娥表示，不滿意港鐵就延遲交還高鐵地皮提交的資料及時間表，會親自或委託運輸及房屋局長張炳良跟進，暫時未能評估涉及多少損失，亦難以向港鐵追討。她又指，當局最初申請的撥款只足夠完成西九第一及第二期工程，至於第三期工程，可視乎香港藝術發展情況考慮是否繼續進行，強調分階段動工是務實做法，不會令西九「支離破碎」，又承認政府起初打算一次過興建所有設施是野心太大。
林鄭月娥又指，政府計劃分階段發展西九地庫，希望申請三億元進行首階段設計及前期工程，但整體價格估算，就由原先超過一百億，增加至二百三十億。對於有議員建議當局局部或全面放棄興建地庫，林鄭月娥指有關設計經過三輪公眾諮詢，若推倒重來是不切實際。