機管局發表興建第三條跑道的環評報告，預計工程對中華白海豚的影響程度屬中等。機管局建築工程環保事務總經理李仲騰表示，工程的確會影響區內海豚，但為免進一步滋擾牠們，會在工程後才著手建設二千四百公頃的海岸公園。保護海洋生態方面，會建議用免挖方法拓地，亦會在海床下鑽挖航油管道，紓緩影響。
為機管局撰寫報告的顧問公司代表指，有關水域並非海豚覓食和社交重地，又指以現有技術，難以確認海豚晚間活動。香港海豚保育學會會長洪家耀質疑，有關海域是海豚重要的移動走廊，又批評報告未有詳細研究海豚的晚間活動。