政府及港鐵傾向將在沙中線考古發現的大部份古蹟，包括兩個宋代方井及部份石砌建築，原址保留，沙中線可能因此超支四十一億元。發展局長陳茂波指，下星期會向立法會提交保育方案，另外，運輸及房屋局局長張炳良說，考古工作至今已令工程滯後最少十一個月。他說餘下其他遺跡，如果選擇保育，可能再需要額外開支一千萬至十三億元，工程或額外再滯後最少四個月。
張炳良指，沙中線延遲通車，在所難免，至於通車初期可否不停土瓜灣站，或分階段通車，他說言之尚早。他指，若未能在下月初落實保育方案，港鐵預料每月將額外增加二億五千萬元開支，涉及保險及索償等費用，工程進度亦相應滯後。而額外開支計算，未包括日後保育費用。沙中線大圍至紅磡段，原定一八年十二月通車；紅磡至金鐘段，原定二零年十二月通車。