中央電視台發現，由於企業排放污水，以及養殖場濫用抗生素，珠江及長江入海口等主要河流及自來水都驗出抗生素。中央台委託專家，在全國多處收集水樣本，驗出珠江廣州段污染嚴重，其中脫水紅霉素等多種常用抗生素，濃度是歐美國家的三至四倍。地處長江下游的江蘇南京，一個民居的自來水樣本，亦驗出抗生素阿莫西林，負責供水的南京水務集團指，水質完全達到國家的一百零六項指標，但有關指標並不包括抗生素。集團未來會在全市供水區域，進行抗生素專項檢測，並會公佈結果。專家表示，長時間攝入抗生素，會產生抗藥性。
中央台同時發現，全國四大抗生素製藥廠之一的山東魯抗醫藥，排放的污水中，抗生素濃度超標一萬倍。不過，負責向環保部門傳遞數據的第三方營運公司就修改相關數據，令污水表面數據並無超標。