台灣食藥署抽查市面的芽菜，四十個樣本中，有三十九個驗出大腸桿菌超標，六個驗出含有金黃葡萄球菌，估計可能在生產、包裝及運輸過程，被環境或人體的微生物污染。
全部芽菜樣本屬非即食類，但台灣民眾普遍會生食芽菜，因此當局以即食食品規範來檢視，提醒民眾若沒有清洗或煮熟食用，可引致噁心、嘔吐及腹痛腹瀉等。