運輸及房屋局局長張炳良說，仍然與中央部委商討，將來廣深港高鐵通車後的一地兩檢安排，由於涉及憲制及法律上問題，需要時間討論，他強調當局仍然以通車時實行一地兩檢為目標。基本法委員會副主任梁愛詩說，西部通道已實行一地兩檢，當年是由人大常委會作出決定，毋須透過基本法附件三立法進行，而是根據基本法第二十條去執行，中央政府可以授權特區政府去做事。經民聯梁美芬認為，可透過基本法九十五條，讓香港與國內司法機關，通過協商進行司法聯繫和互相提供協助，不認為要誇大為內地執法機關來香港執法。

公民黨湯家驊表示，香港有關人權自由和言論表達的法律較內地寬鬆，若果內地執法機關在境內直接執行相關法律，會直接挑戰一國兩制。民主黨胡志偉指，若透過附件三讓國內執法機關到香港執法，勉強讓高鐵發揮效益，是為政府就高鐵所作的錯誤政治判斷，葬送香港高度自治。公民黨主席余若薇認為，如果透過基本法附件三，在港實施高鐵一地兩檢，是對一國兩制及基本法打開缺口，會後患無窮。