港鐵消息人士表示，公司的獨立董事委員會將於明年一月，向獨立股東發通告，解釋財務安排；預料特別股東大會明年二月一日左右舉行，相信會早過立法會財委會批出撥款。消息人士又表示，根據委託協議，現時沒有任何法律依據要港鐵支付超支的費用，但因應工程進度，以及考慮到公眾質疑工程費用會否變成無底深潭，決定同意政府為工程費用封頂。消息人士表示，高鐵工程若果爛尾，後果嚴重，對港鐵和本港的長遠交通可達性都有影響。
消息人士指，若工程完成後，獨立的仲裁員裁定港鐵作為項目管理人的責任，大於委託協議規定的管理費上限，港鐵將會召開另一次特別股東大會，由獨立股東決定港鐵會否承擔額外的責任。