立法會調查廣深港高鐡香港段延誤的專責委員會，港鐵工程總監黃唯銘指，西九龍總站全部建於地底，要將龐大的車站設置在地下層，加上全線路軌亦是地下走綫，工程複雜，對技術的要求相當高，在施工期間亦出現未能遇見的困難，包括地質較預期更複雜、有大量公共管綫需要遷移，以及持續的勞工短缺等。港鐵項目經理盧家榮表示，由於地盤位處舊區，經多次填海，有多種不同的地質，亦有很多管線，到實際施工和挖掘時才知道實際的地質情況。
工程界議員盧偉國質疑，高鐡前期工作時間縮短四個月，質疑是前期工作不足造成延誤。黃唯銘指自己在前期工作階段未加入高鐡團隊，但了解到前期工作符合政府和專家的要求。