發展局長陳茂波在立法會表示，水務處一直監測東江水質，顯示水質良好，符合質量標準，但個別時間會因為特殊情況，令部份指標有偏離。他又指，目前東江水佔全港用水量約七成，日後將軍澳海水化淡廠全面啟用後，都只佔每日用水量的一成，加上要覓地增建海水化淡廠不容易，認為飲用水自給自足的目標不現實。
民主黨黃碧雲和民建聯陳克勤關注，儲存東江水的水塘中，「全氟化合物」含量較儲存雨水的水塘含量更高，擔心影響健康。陳茂波指東江流域範疇廣，接近人口稠密地區，全氟化合物含量較高不出奇，但強調仍然低於英美飲用水標準。