台北市長柯文哲表示，希望總統馬英九，可以特赦因舞弊案被判監的前總統陳水扁，營造「藍綠和解的氣氛」。被問到會否建議候任總統蔡英文特赦陳水扁，柯文哲就指，蔡英文上任後有很多事要處理，尤其是經濟問題。陳水扁在2010年被監禁二十年，去年一月至今，一直獲准保外就醫，柯文哲表示，自己曾任陳水扁的醫生，很清楚他的身體情況，明日到高雄參加活動時，可能會探望陳水扁。