港鐵指，由於懷疑有人進入小蠔灣附近的路軌範圍，港鐵東涌綫及機場快綫列車，途經有關路段時需要慢駛，機場快綫需要十五分鐘一班車，而整體行車時間會較平時多十五至二十分鐘，機場快綫市區預辦登機手續延長至一百二十分鐘。
另外，來往香港站至青衣站列車服務維持每五分鐘一班，香港站來往東涌站就要每十分鐘一班。