港鐵指，約在下午五時四十分，已確定早前進入小蠔灣附近的路軌範圍的人已離開，港鐵東涌綫及機場快綫列車，以及機場快綫市區預辦登機手續陸續回復正常。
受事故影響，港鐵東涌綫及機場快綫列車，途經有關路段一度要慢駛。