風暴下本港航空交通大受影響，機場截至下午五時，全日共有七百三十八班機要取消或延誤。機管局一號客運大樓運作總經理方瑞文表示，雖然天文台指熱帶風暴海馬逐漸遠離本港，但機場範圍一帶天氣仍然惡劣，航機有一段時間受到影響，呼籲旅客向航空公司確認有機位後才前往機場，預料明日是航班升降高峰期。


他又指，為了疏導旅客，機場會於凌晨開始重新編配航班，兩條機場跑道會通宵運作，入境處和海關亦會加派人手維持服務，巴士公司將會增加通宵機場巴士服務，機鐵尾班車將於凌晨一時離開機場。機場無人駕駛列車將會延長服務，餐廳及商戶將會延長服務或通宵營業。國泰及港龍航空表示，晚上九時後會有航班復飛，不過早前宣布直至晚上十時前會取消或延誤的航班，不會因為天文台改發三號強風信號，而改變安排。