港鐵表示，隨著天文台改發三號強風信號，東鐵線以外的列車服務，陸續恢復正常。東鐵線大學站往紅磡方向的路軌，因有樹木倒塌，壓毀架空電纜，東鐵線來往紅磡至羅湖，以及紅磡至落馬洲的列車服務受影響，來往紅磡至羅湖的列車服務，要十五分鐘一班，來回紅磡至落馬洲站就要二十五分鐘一班。港鐵呼籲乘客預留充足時間乘車。
電車服務亦在下午五時半陸續回復正常。港九小輪表示，渡輪服務將於下午六時十五分起陸續回復正常。