審計報告指，在一二至一五學年，學生向自資院校報名，但最終未有入讀而被沒收的留位費同首期學費，每年達二千一百萬至二千六百萬。報告發現，部分提供自資課程機構，出現收生人數低於預計的趨勢，或違反批地條件，審計署認為局方決定批准用地續期前，可能需要徵詢評核委員會意見，而非現時只需由首席助理秘書長評核批准。
報告又提出，由一七至一八學年開始，專上教育學額會超過中學畢業生人數，建議局方檢討決定資助計劃未來路向。