教育局長吳克儉回應審計報告有關教資會出現多項管理問題時表示，教資會認真研究審計報告的建議，局方希望盡快收到改善建議，再研究如何落實執行。至於審計報告揭示，資助大學學費過去十九年從未檢討，是否應該提高，吳克儉就說，教資會已經開始檢討學費，但未來三個學年的學費仍然會維持不變。
另外，有已經在屯門一間直資小學註冊的學生，再獲教育局自行收生學位。吳克儉說，事件不應發生，局方在八月中已經向直資學校發指引，每名申請直資學校的學生家長都簽了同意書，不會有雙重學位。據他了解，有關自資學校是遲了向局方提供文件，文書處理出了亂子。