香港大學校長馬斐森在一個論壇上，提到港大遴選副校長的風波，指不認為事件是干預院校自主，但認為事件拖延超過一年，觀點兩極化，應有更好的管治，已經聘請顧問檢討大學管治。
他又說，學術自由受到挑戰，非香港獨有，香港大學受公帑資助，對公眾有責任，但不代表歡迎侵害自主。