西九文化區發展委員會委員、中大建築學院教授馮永基在一個電台節目表示，西九文化區管理局現時就興建故宮文化博物館作公眾諮詢，是合適做法。他認為，在項目最初期階段白紙一片時，未有內容和設計，難以引起實質討論，又指雖然六星期的公眾參與活動，主要諮詢設計和營運等技術細節，但市民仍可表達反對建館聲音。不過他承認，西九文化區董事局事前未有向發展委員會透露和諮詢委員意見，認為董事局要交代更多細節。
對於西九管理局諮詢故宮博物院意見後，直接委任嚴迅奇為設計顧問。馮永基認為，項目分別由馬會和故宮提供資金和展品，因此兩個機構有很大權力挑揀建築師，確保博物館符合他們意願和文化願景。