運輸署和三間巴士公司計劃分三個階段，試行過海隧巴新分段收費安排，涉及六十條隧巴路線，新的收費會與行走相同路段的非隧巴路線相同，較現時收費減2毫至6.5元。計劃第一階段涉及以南區和深水埗為終點的十六條路線，以筲箕灣開往美孚的102號線為例，新分段收費起點設在深水埗東京街，即路線倒數第三個站，新收費是5.2元，較現時減0.5元。第二和第三階段涉及十個區的路線，會分別在下半年第三和第四季推出。

運輸署向多個區議會提交的文件指，巴士公司不在過海後及繁忙商業區，提供新分段收費，是要避免隧巴路線上落客人數大增，頻頻停站和延長車程。