港大校委張達明認為，馬斐森提早離任，和早前否決陳文敏出任副校長，以及特首委任李國章為校委會主席有關，指馬斐森得不到校委會主席支持，以致內耗嚴重，就任一半時間仍未能埋班，因此難以談得上馬斐森有建樹。張達明又指校委會被壟斷下，由誰人擔任新校長，大家都可以預計得到，令人擔心港大是否仍然可以保障學術自由。
港大學生會會長孫曉嵐表示，對馬斐森辭職感到驚訝，擔心繼任人選，學生會或會要求校委會加開特別會議跟進事件。行政長官參選人胡國興指，大學校長於任期屆滿前辭職，極不尋常。香港社會十分重視大學的學術自由及院校自主，港大及馬斐森應向公眾清楚交代，以釋公眾疑慮。