環保團體環保觸覺表示，機場第三跑道填海工程將會用上大量海沙，而工程承建商需要從中國海砂或東南亞國家輸入海砂，或使用由碎石以機械打碎而成的「機砂」，會多重破壞環境，要求機管局及環保署交代。
環保觸覺義務總幹事譚凱邦指，由遠洋輸入海砂，會令填海地點永久喪失海洋環境，及摧毀海砂源頭的海床。而使用機砂填海，砂內含有的大量石粉會懸浮海中，污染海洋，亦違反環評報告要求。此外，中國海砂日漸短缺及價格上漲，因此可能導致工程嚴重超支，環保觸覺促請擱置三跑工程。