港澳辦副主任馮巍說，一國兩制在香港實踐雖然是成功，但不會低估面臨的問題矛盾及風險挑戰。馮巍在北京一個研討會上說，一國兩制作為全新的制度，存在內在結構性矛盾，香港的行政長官選舉及全國人大常委會就基本法釋法，之所以引起爭議，都是因為制度本身是複合體，要有效運行，包括想要法律界心悅誠服接受釋法，有很長的時間過程。
馮巍說，就中國憲法在香港的適用問題，原則包括任何主權國家的憲法，一定要在每一吋土地適用，以及特別法優於普通法，因此凡是基本法明確規定的內容，憲法的相關規定可以不在香港實施，而基本法沒有規定的，憲法就一定要在香港實施。