機管局在機場第三跑道系統工程中採用名為「深層水泥拌合法」的技術，是本港首次，規模亦是全球最大型之一。三跑系統工程在去年八月展開，首階段在機場島以北填海約六百五十公頃。由於填海範圍中，四成海床是政府指定的污泥卸置坑，機管局採用的新方法，能避免工程令坑內污染物滲漏並影響海洋生態。
新方法會利用鑽頭鑽入預定的海床深度，然後注入水泥漿並攪拌，讓水泥漿與污泥坑內的軟泥混和，令軟泥加固成堅硬的水泥柱；過程中污泥會留在坑內，不影響附近水質。整個工程要製造約二十五萬支水泥柱，至今約完成一萬支。機管局有持續監察水質及白海豚活動，去年八月至今出現過零星的水質污染超標，但與工序無關，多數是受本港西部水域的水質影響；另外發現過一次在工程範圍內有白海豚出沒。