民航處回應有報道指，新航空交通管理系統要每兩星期重啟，以及子系統「電子紙條系統」要每小時作人手檢查。民航處晚上發聲明，指新航管系統去年十一月中啟用以來，一直二十四小時不停運作。為保障系統安全、可靠和穩定運作，民航處根據承辦商建議及具體運作經驗，目前每一至兩星期重新啟動工作席位，屬恆常維護程序；期間空管人員如常提供空管服務，航班運作及航空安全不會受影響。
民航處又證實，航空指揮塔的電子紙條系統，本月二日早上六時許曾間歇性短暫故障，未能處理部分離境航班資料，要改由空管中心提供。經檢查後，系統在約一小時十分鐘後全面回復正常。民航處正與系統承辦商研究事件成因及跟進行動。民航處解釋，由於事件完全沒有影響航空安全及機場運作，民航處早前未有公布。