公民黨立法會議員陳淑莊指，政府提出的高鐵一地兩檢方案認不能接受，認為等同「割地」，違反基本法，形容是人大常委下達決定令香港「自閹」，將西九總站割出去，與深圳灣模式下，運用基本法二十條的做法並不相同，否則日後深港直通巴站、機場亦可以因為「便捷」而做一地兩檢。
民主黨涂謹申指，透過人大常委的決議，既不修改或解釋基本法，按基本法二十條授權特區立法，會減少香港的一部份司法管轄權，在技術上不可行。