政府公布高鐵一地兩檢方案，政黨有不同意見，民主派不接受方案，公民黨立法會議員陳淑莊指，方案等同「割地」，違反基本法，形容是人大常委下達決定令香港「自閹」，將西九總站割出去，民主黨涂謹申指，透過人大常委的決議，既不修改或解釋基本法，按基本法二十條授權特區立法，會減少香港的一部份司法管轄權，在技術上不可行。
民建聯李慧琼歡迎方案，強調會監察內地人員在香港境內執法的情況。經民聯梁美芬表示，當年深圳灣口岸模式亦是兩地簽署合作協議，都有出現租賃情況，亦是經過人大常委通過，有人認為是違背基本法的爭議並不合理。自由黨歡迎方案，希望日後立法時可以通過，又表示不覺得方案是違反基本法，日後會監察方案「三步走」的實施。