來往本港及台灣的航機，受到風暴納沙和海棠影響，截至上午十一時，本港往返台北、台中、高雄以及花蓮的航班，有二十四班取消，三十一班延誤。有到內地公幹，經本港乘坐長榮航空班機回台灣的旅客說，來到香港才得知航班取消，但預約了明天看醫生，感到很焦急，航空公司職員只叫他耐心等候，致電航空公司又沒人接電話，批評公司無交待。有參加台北四天團的市民表示，乘坐的航班由早上十時多，延遲至下午三時多，擔心影響行程，亦感到無奈。
在台灣，有一百四十班台港及國際線班機取消或延誤。長榮航空表示，由於有五百名空中服務員，申請「天災假」，長榮今日再有四十二班離境或入境航班取消，影響約一萬名旅客。