在「天鴿」吹襲下，大澳出現嚴重水浸，水深一度及膝。有大澳居民形容，大澳的風勢強勁，情況相當恐怖，指早上近十時開始，水位開始急速上升，即使政府已經加裝防洪屏障，但海水依然由不同缺口湧入，認為防洪屏障作用不大，形容情況比零八年颱風黑格比吹襲時更嚴重。他又說，現時大澳的水浸情況已逐漸緩和，水位開始逐步下降，居民已開始進行清潔。
受水浸影響，有數十名大澳居民需要由消防員及民安隊成員協助疏散，目前正分別於大澳鄉事委員會辦事處的臨時庇護中心，及香港基督教女青年會大澳社區工作辦事處等地方暫避。