港鐵觀塘綫本月五日信號故障，超過十小時先至修復，運輸及房屋局表示，港鐵需為今次事故撥出200萬元，明年透過票價優惠回饋乘客。運房局在提交立法會的文件解釋，由於事發當日觀塘綫仍維持服務，因此延誤是以列車走完全程的時間，與正常行車時間比較，而當日觀塘綫受延誤最長的一班車，延誤時間為八十三分鐘，因此按機制罰款200萬。翻查資料，東鐵綫五月十八日架空電纜故障，雖然服務受阻時間比今次少，有大約四個半小時，但罰款比今次多，達到750萬元。
立法會交通事務委員會主席、民建聯陳恆鑌認為罰款機制是「為港鐵慳錢」，不符合市民期望，令港鐵有取巧空間，不論故障時間多長，只要維持有限度服務，就可以罰較少金額。民主黨林卓廷表示，今次罰款未能反映事件的嚴重性，及對乘客的影響。