繼屯門興德學校後，元朗惇裕學校被指有「影子學生」問題。惇裕學校被指容許三名缺席考試或缺課的學生升班，並保留他們的學位。校長陳杏軒說，校方早前未能聯絡學生家長，才保留他們的學位，認為是較有人情味的做法。校董文富穩強調，學校的情況和興德學校不同，又指涉事的三名學生當中，有兩人是來自內地，他們獲香港的學校錄取後，又轉到內地學校就學，但學校不可貿然取消學位，他認為教育局應該向學校給予更清晰的指引，處理保留學位的問題，目前學校已經取消了兩人的學位；至於另一名學生，就已經回到學校就學，並快將畢業。
教育局回應說，惇裕學校並無「縮班」危機，校方亦有向局方呈報缺課的個案，但在呈報程序和跟進缺課個案方面，仍需要改善，局方會緊密和學校跟進，確保學生能夠接受教育。