本港多間大學早前相繼出現港獨言論，社會有聲音要求大學糾正。全國港澳研究會副會長劉兆佳說， 院校自主建基於社會對大學的信任和尊重，如大學有違法行為但未能及時處理，不能避免會令社會及政府介入。他又指，當大學自主失去社會的信任和尊重，必然會令大學自主受損 。劉兆佳又說，學術自由和言論自由並非沒有底線，又指現時本港的政治氣氛根本不可能客觀理性地討論港獨，如強行討論亦只是意氣之爭。
另外，對於中聯辦前主任張曉明接替王光亞，出任港澳辦主任 。劉兆佳說，無論何人擔任有關職位，治港方針都是依循中央的政策，包括負起維護國家安全的責任，制止分離主義等，認為當中不存在鷹派和鴿派，因所有官員均須跟從中央的政策方針。