特區政府與廣東省政府，簽訂高鐵西九龍總站實施一地兩檢的《合作安排》，列明內地派駐西九總站的人員，在「內地口岸區」以外區域並無執法權。行政長官林鄭月娥說，特區政府將請求國務院提請全國人大常委會，批准《合作安排》，預料人大常委會下月討論，希望特區政府能在明年二月，向立法會提交本地立法草案。林鄭月娥強調，一地兩檢有堅實的法律基礎，有信心《合作安排》獲人大常委會通過，但承認本地立法才是困難所在，希望議員，特別是非建制派，能基於市民有期望，加上通車有期限，可以順利通過本地立法。

林鄭月娥表示，《合作安排》與政府七月公布的方案，大致相同，但要尊重內地的法律程序，所以未能全面公開，承諾一旦人大常委會通過，就會公開。立法會非建制派議員批評，政府未全面公開《合作安排》是黑箱作業，破壞市民對政府信任。建制派議員認為《合作安排》只是框架式文件，相信到本地立法階段，各界可以進一步了解安排的細節。