西九文化管理局成立的香港故宮文化博物館有限公司，有兩名成員由政府提名，香港本土毛孟靜在立法會一個委員會上說，擔心會令西九文化區發展變成政治符號。民政事務局常任秘書長馮程淑儀回應說，政府提名的兩人中，其中一人是馮程淑儀本人，以西九文化管理局替代董事的身份擔任；另一位則是康文署長。
馮程淑儀說，康文署長過去與故宮方面有很多合作經驗，能夠反映合作過程中的體驗；而公司亦會邀請故宮代表，給予專業意見，但不會插手日常運作及策展事宜，只會就借出藏品提出專業意見，認為做法合理。她又說，兩名政府代表及一名故宮代表，只是佔公司十六位成員的少數。