審計報告發現北大嶼山醫院第一期的設施、服務未有如期啟用，醫院大樓及醫療設備亦未有充分利用。另外明愛醫院第二期重建工程，核准工程預算大幅增加超過四成。
立法會公民黨議員郭家麒回應報告時指，北大嶼山醫院落成至今四年，卻只得四十張病床，婦科及兒科門診仍未投入服務，表示很多東涌的病人需要轉到瑪嘉烈醫院求診，他又預計流感高峰期，將有八成人要轉到瑪嘉烈醫院，預計醫院人手負擔更重，希望醫管局正視。對於明愛醫院第二期重建工程超支四成，郭家麒要求政府重新審視預算，適時增加撥款。