審計報告發現北大嶼山醫院第一期的設施及服務未有如期啟用，醫院大樓及醫療設備亦未有充分利用；而明愛醫院第二期重建工程，核准工程預算大幅增加超過四成。醫管局回應指，同意及接納報告的結果及建議，會逐步落實建議，並加強醫院項目的規劃、行政及監察，包括採取措施確保工程項目估算盡量準確，密切監察醫療服務啟用的進度，研究臨時措施以善用新醫院內的空置地方，及加強小型工程項目的規劃及執行。