港鐵公司已就沙田至中環綫項目主體建造工程的造價估算，完成詳細檢討，並向政府提交最新的估算，沙中綫造價由原先估算超過708億2千萬元，上調至873億2千萬元，超支金額超過165億元，即比原來主體建造工程造價上升兩成三，若連同沙中綫前期工程造價及保護工程費用，總額超過965億7千萬元。
今次調整估算，已考慮各項因素對工程帶來的影響，包括發現考古遺蹟、政府要求增加額外工程，以至延遲或未能完整交接工地等情況。