港鐵沙中綫主體工程超支一百六十五億元，即比原來造價上升兩成三，若連同前期工程、保護工程及顧問費用，沙中綫建造總額近一千億元。立法會議員要求港鐵詳細交代超支原因；立法會鐵路事宜小組主席田北辰指，沙中線超支內部因素佔三成，即涉及約五十億，可以接受，認為整項工程耗時七至八年，有十多個車站，相信港鐵經已盡力，但其他超支因素就無詳盡交代，又指政府遲交工地給港鐵，亦應作出交代，他認為，港鐵公開開支情況，相信是建造費封頂的數字。
立法會交通事務委員會副主席林卓廷認為，沙中綫超支數目驚人，背後涉及不同因素，要求港鐵詳細交代，政府亦應仔細檢視，工聯會議員麥美娟指，港鐵將超支原因歸咎勞工短缺，極不負責任，促請港鐵交代是否涉及管理不善。