警察搜查隊在反恐及安保行動擔當重要角色，早前國家主席習近平訪港，搜查隊引入「射頻識別系統」，先行登記獲准入場人士及發出証件，當入場前經過射頻識別機，顯示照片及相關資訊，提升保安措施。
搜查隊亦會根據地形和環境，運用不同技巧與工具協助搜証，並會出動密閉空間搜查隊，以及高空搜查隊，應付特殊環境的工作。在反恐搜查方面，會預先清場，再配合警犬和各種裝備進行有系統搜查，亦會針對重要人物的車輛和交通路線進行搜查。搜查隊並會協助在發現人體骸骨的密閉集水渠，與及倒塌樓宇的瓦礫搜證。