全國人大常委會副秘書長李飛指，在高鐵西九龍站實施一地兩檢，與十一年前處理深圳灣一地兩檢的做法相同，指內地法律在內地口岸區實施，並非基本法十八條所提及的在香港特區實施。他表示，基本法十八條有一個重要含意，是肯定與基本法不抵觸的香港原有法律，繼續保留為特區法律之外，亦為中央保留一部分對特區事務的立法權，一個是在全國範圍普遍適用的法律，及專門針對香港產生效力的立法，都是全國人大制定的法律。他強調內地口岸區實施的內地法律，適用對象只限於高鐵乘客，並非適用於全部香港居民。
李飛說，基本法是憲制性法律，不可能事無巨細，對預料及預料不到的事都作出規定，不可能簡單用一兩條法律解釋。