行政長官林鄭月娥表示，會不遲於明年二月初，向立法會提交高鐵一地兩檢安排的草案，爭取在暑假休會前獲得通過，以期可以達致明年第三季通車時，可以實施一地兩檢的目標，她期望立法會議員務實理性審議。林鄭月娥又說，一地兩檢的安排，是一國兩制實踐中的新事物，起草基本法時並沒有預見，因此基本法中沒有特定條文回應或適應這種新情況是可以理解；而人大常委會的決定，為一地兩檢安排提供穩健的憲制和法律基礎，強調今次決定並不損害高度自治，不改變香港行政區域的範圍，不減損香港居民依法享有的權利和自由，因此質疑一地兩檢是割地或違反人權的說法，顯然不成立。
林鄭月娥又指，高鐵香港段的工程已完成九成八，指一地兩檢是發揮高鐵最大運輸、經濟、社會效益的最佳方案，是毋庸置疑，並取得市民支持。